微生物檢測系統在實驗過程中將傳統方法的變動減少到最小，從而規避了這些問題。樣品制備和培養條件都和傳統微生物學方法相同。得出的結果也沿用了行業標準薄膜過濾法，因此是和您現今使用的方法是一致的。市面上常見的快速檢測系統會對微生物造成破壞，一旦發生微生物污染事件，調查和微生物的鑒定會受到限制。這會在您的調查過程中造成嚴重的影響，使得您在對根本原因調查分析和糾偏/預防（CAPA）計劃時得不到這方面的幫助。

　　當然微生物檢測系統工作中還需要用到MilliflexPlus泵，Milliflex過濾裝置和預裝培養基的平皿。簡單的2到3步非破壞性方法保證了在減少了培養時間的情況下能夠得到一致的，精確的微生物檢測結果。

　　可替代方法的驗證通常是冗長的而繁復的，對于許多公司來講從傳統方法到新方法都是一個挑戰。微生物檢測系統主要是由于需要快速方法和傳統微生物方法的結果比較是非常復雜的。另外，硬件的復雜性同樣會增加驗證過程的復雜性。基于熒光染色法的，設計用于可過濾產品的快速微生物計數檢測的技術。這一簡單易用的系統應用標準的工業薄膜過濾技術來培養單個樣品中低至1CFU活的可培養的微生物。