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2015年十大生命科學創新產品
[2015/12/4]
《科學家》雜志(The Scientist Magazine)近日評選出2015年十大創新產品,評出了對科研和醫學領域影響較大的測序儀、試劑盒、基因組編輯產品和其他技術,賽默飛、珀金埃爾默、Illumina、安捷倫(Seahorse Bioscience)等生命科學儀器公司紛紛登上榜單。
如今越來越多的實驗室配備DNA測序系統,比如Illumina臺式測序儀。但這些測序儀只能生成幾百bp的讀取,容易丟失一些長距離基因組信息(比如結構變異、多態性和單體型)。今年夏天測序黑馬公司10X Genomics正式推出GemCode測序平臺卻可以解決這一問題。該系統目前售價為75,000美元,可兼容Illumina測序儀。
今年年初,Illumina發布的MiSeq FGx法醫基因組學測序系統,將二代測序技術帶入了法醫實驗室。過去法醫實驗室比較依賴于低分辨率的毛細管電泳測序法,但現在他們可以享受到高分辨率的基因分型。MiSeq FGx能夠很好的檢測高度降解的DNA樣本或混合性樣本,解決傳統方法難以處理的問題。
賽默飛9月份最新發布兩款新一代測序產品Ion S5和Ion S5 XL,從DNA到測序數據,整個過程的手動時間不到45min,可以為人們提供了更流暢的測序流程。這是賽默飛收購Life Tech以來首次擴展測序產品線,新的Ion S5和Ion S5 XL將組成Ion Torrent中端產品線,其價格和通量介于Ion PGM和Ion Proton之間。
去年,Haplogen(現在屬于Horizon公司)的人基因敲除細胞系曾被評上十大創新產品,該產品主要通過引入小插入或缺失,改變人類基因的編碼區域。Horizon公司今年5月發布On Demand Deletions人Hap1細胞系,可以根據用戶要求用CRISPR-Cas9技術刪除特定基因組區域,進一步擴展了基因組修飾規模(可達100 Kb),可以研究去除非編碼區域的效果。
Promega公司19.1 kDa NanoLuc螢光素酶報告系統采用了NanoBiT技術(NanoLuc Binary Interaction Technology),能夠在活細胞中研究蛋白互作。這個熒光標記系統是圍繞一對互補亞基建立起來的,發光明亮而且易于檢測。愛荷華大學Stefan Strack教授評價稱,與類似系統相比,NanoBiT要靈敏得多,而且能用于難以轉染的細胞。
9月份,Sigma Aldrich推出的CRISPR表觀遺傳學激活子,可以通過乙酰化相應組蛋白來啟動目標基因,這使得CRISPR應用從基因組編輯拓展到了表觀基因組編輯。Johns Hopkins大學Richard Lee認為,該產品很適合研究壓力對大腦功能的影響。Sigma Aldrich首席科學家Qingzhou Ji介紹到,除CRISPR激活子外,該產品還可提供靶標Oct4的對照。
珀金埃爾默新推出的Phenoptics平臺包括染色試劑盒、成像系統和分析軟件,可以在福爾馬林固定的組織中對免疫細胞進行原位表型分析。珀金埃爾默定量病理成像解決方案全球主管Jim Mansfield表示,Phenoptics成本在14萬-35萬美元之間,盡管該平臺還處于早期使用階段,但總有一天它會被廣泛應用于腫瘤免疫臨床研究領域。
Seahorse Bioscience推出的XFp細胞能量表型檢測試劑盒,可同時測定活細胞中的兩個主要能量生產通路,且操作簡單。據了解,XFp可以實時檢測線粒體呼吸和糖酵解,計算基線代謝和壓力代謝之間的差異,是唯一能測定細胞代謝潛能的產品。值得一提的是,這家公司在今年9月份被安捷倫以2.35億美元收購。
液體活檢是跟蹤人體癌癥發展的一種極具吸引力的微創方法,作為近年來液體活檢的熱點,循環腫瘤細胞(CTC)分析可提供蛋白、DNA和RNA活性的全面信息,但在血液樣本中收集罕見的CTC并非易事。而Celsee PREP400樣品制備系統就可以從血液樣本分離CTC。除了捕獲活CTC,Celsee PREP400還能將其染色進行多種分析,Celsee ANALYZER則可以對這些細胞進行快速成像分析。
NanoLive公司研發的新型顯微鏡“3D Cell Explorer”,可以利用類似MRI的技術及全息攝影算法的軟件,在不對樣本進行預處理的情況下就可以實時觀察到活細胞的內部運作,實現單細胞和亞細胞水平的分析,適用范圍很廣。該顯微鏡還可利用不同角度的光折射檢測細胞,分辨率可達200nm。