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Science:一滴血檢測病毒感染史
[2015/6/9]
霍華德休斯醫學研究所(HHMI)的研究人員開發了一項新的技術,使人們有可能通過一滴血來檢測目前和曾經任何已知人類病毒的感染情況。這個方法稱為VirScan,是一種有效的測試病毒感染的替代診斷方法。文章發表在最新一期的Science雜志上。
VirScan工作原理是篩查血液中存在的針對任何206種已知感染人類的病毒的抗體。我們的免疫系統在檢測到病毒首次入侵的時候,會產生病原體特異性抗體,即使病毒感染清除后,它仍然可以繼續生產那些抗體持續幾年或幾十年。所以說VirScan不僅能識別免疫系統正在積極應對的病毒感染,而且還提供了個人過去的感染史。
Elledge和他的同事合成了超過93000個病毒編碼蛋白的DNA短片段。他們將這些DNA片段插入細菌感染病毒——噬菌體中。每個噬菌體生產相應的蛋白質肽單位,并會將肽表露在其表面外殼上。這些噬菌體將1000多種人類病毒中發現的所有蛋白質序列都表露了出來。血液中的抗體通過識別嵌在病毒表面抗原決定簇,找到病毒目標。為了執行VirScan分析,所有的被改造過表露一定肽的噬菌體被混合到血液樣品中。血液中的病毒抗體發現并結合特定的病毒抗原決定簇上(這個抗原決定簇是在改造表達的肽結構內)。然后,科學家提取抗體,洗去除了少數結合在抗體上的噬菌體以外的其他物質。通過測序這些噬菌體的DNA,便可以識別哪些病毒肽片段能被血樣中的抗體識別結合。這便告訴我們到底一個人的免疫系統以前遇到過那些病毒,無論是通過感染還是通過接種疫苗。 Elledge估計需要大約2-3天處理100個樣本,假設在測序工作保持在最佳狀態。
為了測試方法的可行性,研究人員使用它來分析從已知感染了病毒(特別包括HIV和丙肝)患者那得到的血樣。事實證明,它的檢測很準確。準確度保持在95%至100%,而且特異性靈敏——對于沒有感染的個人,并未得到錯誤地識別。因此研究人員表示相信它的真實性。
Elledge和他的同事們用VirScan分析569個來自四個國家的個人的抗體,檢查了大約1億的潛在抗體/抗原決定簇的相互作用。他們發現,平均每個人有針對十個不同病毒的抗體。正如預期的,抗某些病毒更常見于成年人而非兒童,這表明孩子尚未暴露于這些病毒中。位于南非、秘魯、泰國的個人,多半在美國的個人有抗更多病毒的抗體。研究人員還發現,艾滋病病毒感染者有比非HIV感染者存在更多的抗病毒抗體。
Elledge說,這個方法其實不限于對抗體的檢測。他們正在用它來尋找那些攻擊人體自身的組織并與癌癥相關的某些自身免疫性疾病的抗體。類似的方法也可用于篩選其它類型的病原體抗體。
借助VirScan,科學家可以通過運行一個測試就能確定哪些病毒感染了個體,而不受限于必須對特定病毒進行分析。這種中立的方法可以有助于發現影響個體健康的意外因素,同時也增加了分析比較大量人口病毒感染情況的可能。這個全面的病毒分析大約耗費25美元/每血樣。