農產品質檢體系為監管提供了有力支撐。目前，農業部已依托質檢體系初步建立了基本覆蓋全國主要大中城市和農產品產區，對重點農產品和農業投入品開展例行監測、專項監測和監督抽查的一整套農產品質量安全監測制度，對于客觀準確評價和把握我國農產品質量安全狀況及發展形勢起到了重要的作用。各省(區、市)農業部門也建立了農產品質量安全監測制度，定期開展農產品質量安全監測。部、省兩級每年監測農產品和農業投入品樣品總數近40萬個。

　　同時，通過定期會商分析和通報農產品質量安全監測結果，加強檢打聯動、執法處罰和信息發布，在全國形成了以監測為抓手、政府主導、社會廣泛參與監督的農產品質量安全監管機制，監管力度也越來越大。從2013年農業部組織開展的全國農產品質量安全例行監測結果來看，農產品質量安全監測總體合格率為 97.5%，同比上升0.8個百分點。蔬菜、茶葉、畜禽產品和水產品監測合格率分別為96.6%、98.1%、99.7%和94.4%，同比分別上升 0.6、5.1、0.1和3.9個百分點。2013年與2001年相比，蔬菜農藥殘留、畜產品瘦肉精監測合格率提高了30多個百分點，說明我國農產品質量安全水平較本世紀初有了大幅提高，總體保持較好水平。

　　在加強質檢體系建設的同時，農業部注重加強質檢機構管理。一方面是完善規章制度。依據《農產品質量安全法》、《食品安全法》等法律法規，農業部相繼出臺了《農產品質量安全檢測機構考核辦法》、《農業部產品質量監督檢驗測試機構管理辦法》、《農產品質量安全檢測機構考核評審細則》、《農產品質量安全檢測機構考核評審員管理辦法》、《農業部產品質量監督檢驗測試機構基本條件》和《農業部產品質量監督檢驗測試機構審查認可評審規范》等規范性文件，加強農產品質量安全檢測機構管理。另一方面是加強檢測人員培訓。農業部和各級農業部門近年來每年都組織開展質檢機構負責人和檢測人員培訓，統一編制了基層檢測人員培訓教材和光盤，定期舉辦全國性的農產品質量安全檢測技能競賽活動，整個隊伍的能力水平有了明顯提高。