越來越多醫療儀器依賴于軟件，于是引發電腦使用者普遍遭遇的問題:程序漏洞、系統崩潰和遭計算機病毒或黑客襲擊的風險。

　　希臘帕特拉斯大學研究者發現，1999年至2005年間，在美國售出的所有基于軟件的醫療儀器中，有三分之一曾因軟件故障被召回。美國馬薩諸塞大學計算機學教授凱文·傅也估算過，2002年以來，被召回的醫療儀器超過150萬臺。

　　醫療儀器軟件一旦出現紕漏或遭遇外部攻擊，可能造成可怕后果。

　　上世紀80年代，加拿大生產的放射治療儀TheraC—25軟件設計存在漏洞，曾引發多起醫療事故，至少5名病人因接受了超劑量輻射而喪命，成為現代醫療史上一個著名事件。

　　那些無線聯網的儀器也可能遭遇黑客的惡意襲擊。凱文·傅教授和同事曾在2008年合作發表一篇論文，詳細描述如何通過遠程操控篡改一臺植入式心臟電擊減顫器的程序，讓它在需要時延遲啟動，或制造多余的電擊。