固相萃取的基本步驟：
（1）SPE柱預處理（活化）：無論是自行裝填的還是商品化的SPE柱，在使用之前大多都是干燥的狀態，為了得到高回收率和良好的重現性，向SPE柱添加樣品前，需要對SPE柱進行預處理。
（2）樣品過柱（上樣）：樣品過柱的主要目的是要將樣品中的目標化合物定量地保留在SPE柱上，使其與未被保留的樣品基質及干擾物分離。具體方法是將樣品添加至SPE柱中，加壓使其通過SPE柱，并控制樣品流速。
（3）SPE柱洗滌（淋洗）：為了減少在分析過程中雜質對目標化合物的干擾，延長儀器的使用壽命，在不影響目標化合物回收率的前提下，應盡可能地除去干擾物。在固相萃取中，經常通過SPE柱的洗滌來達到這個目的。用適當的洗滌劑選擇性的洗脫吸附力弱的雜質，目標化合物依然保留在SPE柱上。洗滌劑的選擇取決于雜質的性質及最后的分析手段。
（4）目標化合物洗脫：目標化合物的洗脫在整個固相萃取過程中是至關重要的一步，為了最大限度地將目標化合物洗脫下來，必須選擇合適的洗脫劑。

全自動固相萃取儀應用領域：
1、環境行業：殺蟲劑和除草劑、石油和油脂、多環芳烴和半揮發性有機物、爆炸物、多氯聯苯、溴化阻燃劑、二噁英和呋喃類有機污染物、苯脲除草劑。
2、制藥、天然產物行業：液體中活性成分分析、包裝飲用水中的可萃取物分析、藥物包裝中可萃取物分析、維生素和抗生素。
3、食品、飲料行業：殺蟲劑和除草劑、包裝飲料中的污染物、農殘、天然產品、飲食補充劑。
4、生命科學領域：基因研究、大分子蛋白質前處理。
5、司法鑒定領域：殘留物的富集、有毒物質的篩選等前處理。
6、其它領域：煙草分析、香精香料分析、化妝品分析等絕大多數有機化合物分析前處理。