因為反滲透膜的脫鹽率是固定的，所以當源水硬度過高時，如果不對源水進行處理的話，很容易會使反滲透膜結垢，源水通過增壓泵加壓使大于反滲透膜孔徑的雜質被反滲透膜截留下來通過廢水排出，純水則通過膜中心的收集管回收下來流向下一級，而硬度則主要是鈣鎂離子形成的，它們的分子直徑較大，容易與其他化合物形成沉淀結垢，如果反滲透膜一旦結垢的話，那么會堵塞膜孔，久而久之反滲透膜就報廢了。

　　所以要對源水進行軟化處理，把鈣鎂離子通過軟化器轉換成鈉離子，而鈣鎂離子則被軟化器吸附通過排水口排出。

　　一般建議配置兩級反滲透，這樣的話對后級裝置可以起到很好的保護作用