在正相色譜分離模式中，水是一種溶劑強度非常高的溶劑，即便流動相中有少量的存在就能對保留時間產生強烈的影響，特別是在硅膠或氧化鋁為固定相而使用的流動相非極性或疏水性很強的情況下尤其是這樣。因為烷烴類溶劑天然含水量極低，基于無水烷烴的流動相，需要很長時間才能和環境中水分達成平衡。所以，正相色譜柱使用幾天后就觀察到保留時間有漂移的現象是司空見慣的。可能正是存在這個令人頭疼的問題，成為了當今正相色譜沒有反相色譜那么普及常用的主要原因。

　　使用溶劑強度ε0大于0.35的流動相，保留時間漂移的問題不大，如用的是極性基團鍵合的正相固定相，流動相的ε0值還可以更小些。此外，還有一個非常有效的改善正相色譜保留時間重現性的方法：使用和水“半飽和”的正相流動相。

　　“半飽和”流動相配置方法：將無水的非極性流動相分成兩半;其中一半中加入一定量水，并混勻攪拌約一小時，靜止分層后，將多余的水相全部除去;將無水的一半流動相和已與水飽和過的另一半流動相兩部分重新混合在一起，就配成了“半飽和”流動相。

　　使用“半飽和”流動相，使色譜柱平衡時間大大加快，色譜柱的含水量相對不會受環境中水份含量的很大影響，可以極大改善色譜保留時間的重現性;另外流動相中的一定量水分，首先和固定相表面的活性最大位點作用，結果使表面不均一性減少，非特異性吸附影響減弱，可獲得更對稱的峰形。